@MASTERSTHESIS{ 2011:791148245,
 	title = {Estudo do mecanismo catalítico da enzima pirofosforilase do fungo moniliophthora perniciosa por de métodos QM/MM},
 	year = {2011},
 	url = "http://tede2.uefs.br:8080/handle/tede/1058",
 	abstract = "Em 1989 a cultura brasileira do cacau sofreu uma queda em sua produção, o que, em parte, pode ser explicada pelo surgimento e desenvolvimento do fungo Moniliophthora perniciosa, que é responsável por uma praga conhecida como vassoura-de-bruxa do cacaueiro. Tal praga afeta as plantações de cacau levando a grandes danos sócio-econômicos e, devido a isto, o Brasil passou a importar esta matéria prima. Na busca por um controle efetivo da vassoura-de-bruxa, a rota metabólica que leva a síntese da quitina, principal constituinte da parede celular do fungo, foi analisada na perspectiva da seleção de um alvo potencial para a inibição da sua síntese. O alvo selecionado na rota metabólica foi a enzima pirofosforilase, a qual é a responsável em catalizar a reação de formação do intermediário UDP-N-acetilglicosamina. A inibição da formação de UDP-N-acetilglicosamina afetará a formação de quitina e, consequentemente, a síntese da parede celular, indispensável à sobrevivência do fungo. O presente trabalho consiste em um estudo do mecanismo da reação catalisada pela pirofosforilase do M. perniciosa para a formação da UDP-N-acetilglicosamina, através de métodos de química computacional. Foram empregados cálculos de dinâmica molecular (DM) e Mecânica Quantica/Mecânica Molecular (QM/MM) para desenvolver os estudos reacionais assumindo como mecanismo básico a substituição nucleofílica bimolecular (SN2). Uma estrutura de transição com um átomo de fósforo pentavalente foi elucidada, a qual realiza interações com os seguintes resíduos do sítio catalítico Gli-112, Gli-113, Arg-116, Lis-123 e Gli-225. Tais resíduos devem ser explorados para o planejamento racional de novos candidatos a inibidores da referida enzima. Foi realizado também um escaneamento da reação com a adição do cátion divalente Mg+2 baseando-se na literatura quanto à localização do ponto de inserção deste átomo no sistema. Esta simulação produziu uma estrutura intermediária com fosfato em caráter dissociativo, o escaneamento não demonstrou redução da energia de ativações o que como hipótese explicativa sugere-se um local inadequado para a adição do fosfato ou, em ultima análise, um mecanismo de catálise que não perpassa por SN2 na presença do cátion de magnésio.",
 	publisher = {Universidade Estadual de Feira de Santana},
 	scholl = {Mestrado Acadêmico em Biotecnologia},
 	note = {DEPARTAMENTO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS}
}