@MASTERSTHESIS{ 2016:786970229, title = {Modelagem comparativa e triagem virtual hierárquica para identificação de moduladores das OBPs de Lutzomyia Longipalpis}, year = {2016}, url = "http://localhost:8080/tede/handle/tede/441", abstract = "A Leishmaniose Visceral (LV) é a segunda doença vetorial mais importante do mundo, transmitida nas Américas por Lutzomyia longipalpis, o controle do vetor é indispensável à prevenção da doença. Mas como não é possível identificar onde ocorre a oviposição, o combate é direcionado aos insetos adultos, utilizando armadilhas impregnadas com atrativos químicos. Considerando que as Proteínas Ligadoras de Odor (OBPs) atuam no primeiro nível de seleção dos odores, este trabalho utilizou uma metodologia in silico para identificar potenciais moduladores químicos olfativos do vetor baseando-se na estrutura das OBPs e de ligantes conhecidos. Para isso, foram preditas as estruturas tridimensionais (3D) de OBPs de L. longipalpis por três métodos de modelagem comparativa. O melhor modelo, predito pelo I-Tasser, foi refinado por Dinâmica Molecular no Gromacs. Então, numa abordagem hierárquica da triagem virtual, os compostos naturais do ZINC12 mais próximos dos típicos ligantes de OBPs no espaço químico global, fornecido pelo ChemGPS-NP, foram avaliados e escalonados quanto à afinidade com o sítio ortostérico da OBP, pelo acoplamento molecular no DOCK6. Os compostos foram pontuados pelo Gridscore, em seguida, os cem melhores classificados foram submetidos à pontuação pelo Amberscore, que levou em conta a flexibilidade tanto da OBP como dos ligantes acoplados. As conformações de menor energia interagiram com um bolsão hidrofóbico através dos resíduos Met6, Ala9, Gly10, Glu11, Arg14, Met53, Leu74, Phe118, Phe119, Pro120; grupamentos amino formaram pontes salinas com a carboxila do Glu11. Além disso, os resíduos Phe119, Asn29 e Gln69 formaram ligações hidrogênio, sendo que, este último resíduo formou ligações-H aceptoras e doadoras.", publisher = {Universidade Estadual de Feira de Santana}, scholl = {Mestrado Acadêmico em Biotecnologia}, note = {DEPARTAMENTO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS} }